15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0711 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0711  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3929  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.885307  normal  0.975733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4955  hypothetical protein  27.78 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.759511  normal  0.0203033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1617  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1734  hypothetical protein  27.91 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00739369  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19310  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  30.34 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140602  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3539  hypothetical protein  27.59 
 
 
135 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3263  hypothetical protein  29.07 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455333  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1415  Polyketide cyclase/dehydrase  22.05 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2109  hypothetical protein  28.24 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2351  hypothetical protein  28.24 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2790  Polyketide cyclase/dehydrase  39.22 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3086  hypothetical protein  25.84 
 
 
136 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3146  hypothetical protein  25.84 
 
 
136 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0787309  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3291  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>