13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3567 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  77.34 
 
 
692 aa  1091    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  100 
 
 
687 aa  1412    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  45.27 
 
 
628 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 
558 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  29.88 
 
 
369 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3154  hypothetical protein  26.29 
 
 
322 aa  62  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1891  hypothetical protein  39.56 
 
 
135 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092595 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  47.83 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  24.18 
 
 
415 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  22.81 
 
 
228 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3440  hypothetical protein  35.59 
 
 
311 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  23.96 
 
 
216 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>