14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0342 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  67.57 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  52.33 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  49.3 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  54.41 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  52.94 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  44.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  47.46 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  32.35 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  47.92 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  46.43 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  40.82 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  29.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  35.85 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>