13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4661 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  77.42 
 
 
288 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  73.96 
 
 
292 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  70.15 
 
 
294 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  62.59 
 
 
295 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  63.6 
 
 
290 aa  354  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  59.35 
 
 
296 aa  328  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  58.97 
 
 
296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  51.72 
 
 
276 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  51.65 
 
 
220 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  32.39 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  29.29 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  34.07 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>