13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4479 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  64.46 
 
 
288 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  63.1 
 
 
292 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  62.82 
 
 
295 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  63.6 
 
 
289 aa  354  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  60.65 
 
 
294 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  56.55 
 
 
296 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  57.71 
 
 
296 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  53.31 
 
 
276 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  53.4 
 
 
220 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  35.21 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  31.08 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  25.37 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>