19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4147 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  64.38 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  63.01 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7281  hypothetical protein  57.81 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  50 
 
 		 561 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  47.37 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  54 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  43.06 
 
 		 288 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  38.16 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2659  hypothetical protein  35.38 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125976  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2631  hypothetical protein  45.1 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  43.86 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  41.79 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  37.68 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  40.98 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.51473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>