39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3805 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3805  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.702256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  53 
 
 		 464 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  53 
 
 		 464 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  53.06 
 
 		 462 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  46.08 
 
 		 437 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  48.18 
 
 		 471 aa  97.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  52.75 
 
 		 471 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  43.4 
 
 		 465 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  50.5 
 
 		 471 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  48.96 
 
 		 474 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  45.83 
 
 		 468 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  48.96 
 
 		 470 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  48.11 
 
 		 470 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  46.85 
 
 		 493 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  49.48 
 
 		 484 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  46 
 
 		 498 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  44.21 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  46.67 
 
 		 487 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  45.56 
 
 		 470 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  44.12 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  45.26 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  44.44 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  38.74 
 
 		 470 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  41.44 
 
 		 479 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  43 
 
 		 466 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  46.88 
 
 		 494 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  45.83 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  43.01 
 
 		 473 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  46.15 
 
 		 464 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  39.39 
 
 		 470 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  43.96 
 
 		 461 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  40.18 
 
 		 474 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  47.92 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  47.92 
 
 		 470 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  38.38 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  46.15 
 
 		 462 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  49.46 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  36 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  35.29 
 
 		 391 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>