41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2999 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2999    100 
 
 		 405 bp  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  83.25 
 
 		 966 bp  137  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 951 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 462 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  85.38 
 
 		 984 bp  107  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  85.5 
 
 		 990 bp  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  85.5 
 
 		 990 bp  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  85.5 
 
 		 990 bp  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  85.5 
 
 		 861 bp  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    97.83 
 
 		 2579 bp  83.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4969    90.16 
 
 		 114 bp  73.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    93.18 
 
 		 980 bp  63.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  93.18 
 
 		 387 bp  63.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1157    91.3 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  90 
 
 		 513 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  90 
 
 		 960 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 960 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 960 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    90 
 
 		 950 bp  60  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  90 
 
 		 960 bp  60  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 1047 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 993 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    90.91 
 
 		 1062 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 993 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    90.91 
 
 		 672 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 993 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 1068 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 993 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 993 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    90.91 
 
 		 1031 bp  56  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  100 
 
 		 252 bp  54  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  88 
 
 		 1392 bp  52  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  88 
 
 		 834 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  90.24 
 
 		 594 bp  50.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>