45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2954 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  93.73 
 
 		 277 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.76 
 
 		 277 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.87 
 
 		 277 aa  464  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.3 
 
 		 277 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.3 
 
 		 276 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  83.27 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  84.01 
 
 		 276 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.48 
 
 		 273 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.17 
 
 		 270 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.33 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.65 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.33 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.82 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.82 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.7 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.83 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.31 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  44.19 
 
 		 258 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.27 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.27 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  40.59 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.13 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  39.39 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.64 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  35.85 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  37.88 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.57 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.94 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.34 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.85 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  34.07 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  27.85 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  26.53 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  27.64 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  24.89 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  25.68 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  27.65 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  30.29 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  26.07 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  26.73 
 
 		 238 aa  42.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  29.65 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  23.63 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  29.65 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  29.65 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>