18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2022 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2022  phage protein  100 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1723  phage protein  53.54 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.010366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3984  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  33.33 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0282  uncharacterized phage protein  34.31 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  34.74 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1622  phage protein DNA packaging protein  33.33 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.248492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1478  phage protein DNA packaging protein  31.31 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1365  hypothetical protein  31.63 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2609  uncharacterized phage protein (possible DNA packaging)  35.16 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.501602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1290  phage protein DNA packaging protein  40 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4286  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.285815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0867  hypothetical protein  29 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6247  Phage-related protein, DNA packing  30.11 
 
 		 113 aa  43.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00560086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3941  phage protein  32.91 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5156  hypothetical protein  34.04 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1084  DNA packaging protein, putative  32.97 
 
 		 95 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4467  phage protein  30.77 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>