52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1261 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 53 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  92.31 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  88.46 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  88.46 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  88.46 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  88.46 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  76.92 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  75 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  75 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  69.23 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  69.23 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  69.23 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  70.83 
 
 		 64 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  61.54 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  61.54 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  61.54 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  68.75 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  59.62 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  60.78 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  72.97 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  54 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>