32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0272 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  58.91 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  67.21 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  72.5 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  90 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  70 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  86.67 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  77.78 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  42.95 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  80 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  76.67 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  55.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  52 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  55.36 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  32.88 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  55.36 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  81.48 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  82.14 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  61.9 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  56.41 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  66.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  30.19 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  37.84 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  69.23 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  32.87 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  31.54 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  32.87 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  68 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  68 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>