23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5190 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5190  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  819    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726392  normal  0.528978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2471  hypothetical protein  37.88 
 
 		 208 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2472  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  39.19 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.14 
 
 		 147 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.13 
 
 		 147 aa  53.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  37.17 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4175  hypothetical protein  32.92 
 
 		 165 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  29.08 
 
 		 153 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.55 
 
 		 153 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  38.18 
 
 		 168 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  31.87 
 
 		 158 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.18 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>