13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2795 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2795  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.400114  normal  0.154233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1874  hypothetical protein  58.98 
 
 
244 aa  244  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  34.85 
 
 
304 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2852  hypothetical protein  36.47 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2657  hypothetical protein  36.43 
 
 
248 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000346447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5331  hypothetical protein  28.14 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  29.73 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4252  hypothetical protein  26.89 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0626578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0728  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  29.79 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  28.87 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  26.47 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>