24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0493 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  100 
 
 
418 aa  866    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  42.58 
 
 
408 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  37.68 
 
 
412 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  35.92 
 
 
415 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  35.89 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  36.12 
 
 
412 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  34.53 
 
 
412 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  35.49 
 
 
412 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  35.25 
 
 
412 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  35.25 
 
 
412 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  35.34 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  32.2 
 
 
416 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  31.63 
 
 
413 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  34.81 
 
 
413 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  31.49 
 
 
417 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  32.39 
 
 
431 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  33.5 
 
 
405 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  30.97 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  27.65 
 
 
461 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  27.11 
 
 
413 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  24.56 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  25.62 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  25.41 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>