28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0245 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7218  GCN5-related N-acetyltransferase  62.98 
 
 
213 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  53.81 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  55.19 
 
 
212 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0302  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00317404  normal  0.0799447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  28.11 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0742663  normal  0.331805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  28.5 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1305  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
217 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0958  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
208 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0531  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.45 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101247  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02530  acetyltransferase  30.96 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.406805  normal  0.416971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1790  GCN5-related N-acetyltransferase  26.34 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0226769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.634781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22280  acetyltransferase  38.26 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3010  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
197 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2743  acetyltransferase  32.1 
 
 
197 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.93 
 
 
138 aa  41.6  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>