9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0025 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115082  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0047  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101821  hitchhiker  0.0000000869798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0016  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.060369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00171316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>