25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4934 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4934  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6756  hypothetical protein  57.58 
 
 
165 aa  197  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2912  hypothetical protein  51.32 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0696  hypothetical protein  47.5 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8223  hypothetical protein  54.61 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0658  hypothetical protein  59.7 
 
 
177 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0671  hypothetical protein  59.7 
 
 
177 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758778  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0651  hypothetical protein  59.7 
 
 
177 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02660  Protein of unknown function (DUF2596)  50.33 
 
 
181 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0828  hypothetical protein  52.53 
 
 
176 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0085  hypothetical protein  53.16 
 
 
169 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0990  Protein of unknown function DUF2596  48.41 
 
 
196 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4608  Protein of unknown function DUF2596  46.05 
 
 
177 aa  151  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4337  Protein of unknown function DUF2596  47.55 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0957  hypothetical protein  44.74 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4049  hypothetical protein  52.55 
 
 
199 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5954  hypothetical protein  47.95 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10495  hypothetical protein  57.58 
 
 
183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000885199  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0332  hypothetical protein  44.53 
 
 
190 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0628  Protein of unknown function DUF2596  47.2 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0495  hypothetical protein  42.57 
 
 
173 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03660  Protein of unknown function (DUF2596)  46.31 
 
 
201 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.861967  normal  0.289484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6163  hypothetical protein  45.52 
 
 
164 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0399  hypothetical protein  46.27 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0455  hypothetical protein  40.43 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.576485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>