9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3888 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1371 bp  2137    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1374 bp  2137    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3734    100 
 
 		 2860 bp  2900    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.222012  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    100 
 
 		 2845 bp  5640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    85.77 
 
 		 2389 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    85.77 
 
 		 4277 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    85.6 
 
 		 2995 bp  204  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    89.41 
 
 		 2811 bp  194  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    83.91 
 
 		 2527 bp  163  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>