14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2224 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2224  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  202  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000608293  normal  0.302453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0270  hypothetical protein  52.63 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.154273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0231  hypothetical protein  51.58 
 
 
99 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0773  hypothetical protein  48.39 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0660  hypothetical protein  53.54 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2647  hypothetical protein  47.66 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.601256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3137  Domain of unknown function DUF1905  47.37 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.438812  hitchhiker  0.000153931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2479  hypothetical protein  42.22 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1608  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.676754  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2840  hypothetical protein  37.23 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1447  hypothetical protein  35.87 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0152  Domain of unknown function DUF1905  36.96 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674001  normal  0.145217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2209  hypothetical protein  29.35 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4116  hypothetical protein  37.65 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.862862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>