58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2046 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2046  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156175  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  98.96 
 
 
455 aa  190  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  98.96 
 
 
455 aa  190  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  98.96 
 
 
455 aa  190  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  58.67 
 
 
449 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  58.67 
 
 
449 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  58.67 
 
 
449 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  58.67 
 
 
449 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  58.67 
 
 
449 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  57.33 
 
 
447 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  57.33 
 
 
447 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  57.33 
 
 
447 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  57.33 
 
 
447 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  57.33 
 
 
447 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  53.16 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  53.16 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  53.16 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  53.16 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  55.26 
 
 
451 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  53.16 
 
 
462 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  55.26 
 
 
451 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  45.24 
 
 
459 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  45.24 
 
 
459 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  45.24 
 
 
462 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  45.24 
 
 
462 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  45.24 
 
 
462 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  45.24 
 
 
462 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  45.24 
 
 
462 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  35.79 
 
 
427 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0139  transposase mutator family protein  38.89 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  36.36 
 
 
393 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  36.36 
 
 
404 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  38.1 
 
 
408 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  44 
 
 
424 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  38.1 
 
 
408 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  38.1 
 
 
408 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2224  hypothetical protein  53.85 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0536886  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  40.98 
 
 
403 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10938  transposase  44.9 
 
 
439 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4522  transposase, mutator type  39.22 
 
 
430 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0698256  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3764  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3465  transposase mutator type  41.82 
 
 
425 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000204255  normal  0.0284562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>