71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1389 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  62.78 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  50.73 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.73 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  52.36 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  44.81 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.19 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  48.59 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  47.39 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  47.78 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  46.99 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.76 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.48 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.19 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.85 
 
 		 276 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.64 
 
 		 323 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.49 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  41.57 
 
 		 1139 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  24.55 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.53 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4506  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  30.17 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.65 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2735  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.68 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.220722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  29.07 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.11 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27160  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM-like protein  29.27 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  24.22 
 
 		 499 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.96 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1845  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.1 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000266439  normal  0.132437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2863  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.05 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.19 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.993722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2225  oxidoreductase  38.46 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.529414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3000  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.89 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4728  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.18 
 
 		 336 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.090428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00244  predicted oxidoreductase with FAD-binding domain  26.19 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3319  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.19 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00247  hypothetical protein  26.19 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.68 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1008  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.29 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119668 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4659  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.16 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.46 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0739  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, beta subunit  27.78 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3375  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.4 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2975  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.42 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2340  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.42 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0331  FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase  25.71 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2948  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.11 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2954  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.42 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8336  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.1 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.69279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3589  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.45 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0296  FAD binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.29 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2183  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.48 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5489  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.26 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1144  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.62 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.64 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1224  putative oxidoreductase, molybopterin binding subunit  35.64 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.49 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.29 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.94 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5990  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.61 
 
 		 333 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292973 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.75 
 
 		 292 aa  42  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3028  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.58 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.29 
 
 		 292 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>