15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0921 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0921  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0922  hypothetical protein  57.89 
 
 
236 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3295  hypothetical protein  27.39 
 
 
300 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3051  hypothetical protein  32.73 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4790  hypothetical protein  35.03 
 
 
226 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3095  hypothetical protein  25.5 
 
 
277 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6725  hypothetical protein  31.18 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6724  hypothetical protein  34.58 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3999  hypothetical protein  37.78 
 
 
131 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3094  hypothetical protein  34.52 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04790  hypothetical protein  33.66 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3296  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6726  hypothetical protein  31.82 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16850  hypothetical protein  30.95 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.034716  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6723  hypothetical protein  30.7 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>