12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0322 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  73.11 
 
 
121 aa  183  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  64 
 
 
192 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  34.69 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  33 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  29.66 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  22.22 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  32.58 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  30.21 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  27.97 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>