29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17031 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 
245 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 
245 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  83.67 
 
 
245 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  79.18 
 
 
245 aa  363  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  79.18 
 
 
245 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  79.18 
 
 
245 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  77.96 
 
 
245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  74.69 
 
 
243 aa  332  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  69.11 
 
 
246 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  73.88 
 
 
243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  53.5 
 
 
242 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  48.18 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  48.18 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  45.71 
 
 
244 aa  205  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  49.39 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  28.17 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  29.67 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  26.02 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  27.08 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  27 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  29.24 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  29.37 
 
 
235 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  29.45 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  27.81 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  26.05 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  27.43 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  25.1 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  24.07 
 
 
237 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>