31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0475 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  37.38 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5551  hypothetical protein  35.4 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.074617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  49.28 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4726  hypothetical protein  38.78 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227983  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4217  hypothetical protein  40.74 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2541  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2736  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4275  hypothetical protein  37.35 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  49.25 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  42.42 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2642  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06650  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911557  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4340  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0385  hypothetical protein  43.33 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
69 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2751  transcriptional regulator-like protein  47.92 
 
 
53 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  45.65 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  38.03 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
75 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
74 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>