15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2541 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2541  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2736  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  77.36 
 
 		 106 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5551  hypothetical protein  61.47 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.074617 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4726  hypothetical protein  56.76 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4275  hypothetical protein  45.22 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  35.51 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  35.51 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  35.51 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  31.43 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  26.09 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  26.09 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  32.88 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>