51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0717 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  100 
 
 
482 aa  946    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  50.61 
 
 
489 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  48.39 
 
 
493 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  37.38 
 
 
530 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  45.38 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  43.65 
 
 
474 aa  310  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  34.81 
 
 
523 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  35.77 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  42.44 
 
 
471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  35.58 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  35.19 
 
 
523 aa  299  6e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  40.45 
 
 
475 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  41.7 
 
 
471 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  32.62 
 
 
512 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  31.26 
 
 
498 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  28.97 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  30.43 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  30.47 
 
 
471 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  29.8 
 
 
462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  29.35 
 
 
465 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  28.28 
 
 
489 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  30.57 
 
 
472 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  30.11 
 
 
481 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  28.77 
 
 
479 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  29.09 
 
 
471 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  28.14 
 
 
495 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  31.03 
 
 
524 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  29.47 
 
 
471 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  30.28 
 
 
524 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  30.08 
 
 
524 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  29.07 
 
 
520 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  30.44 
 
 
464 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  59.18 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3193  hypothetical protein  50.94 
 
 
129 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
293 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  33.07 
 
 
134 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  41.46 
 
 
508 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2583  hypothetical protein  55.77 
 
 
127 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3523  hypothetical protein  55.77 
 
 
127 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  31.19 
 
 
298 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2341  hypothetical protein  34.71 
 
 
135 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0805  hypothetical protein  48.08 
 
 
127 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  38.1 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  35 
 
 
497 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0582  hypothetical protein  30.88 
 
 
137 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.837008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  23.65 
 
 
280 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0034  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308035  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  26.2 
 
 
347 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02121  hypothetical protein  32.43 
 
 
123 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  46.15 
 
 
134 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01201  hypothetical protein  49.02 
 
 
128 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>