16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0188 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0188  ribosome biogenesis protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0915  Suppressor Mra1 family protein  47.73 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13379  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0557  ribosome biogenesis protein  43.84 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0820  ribosome biogenesis protein  44 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2054  ribosome biogenesis protein  43.84 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.532085 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1803  ribosome biogenesis protein  40.3 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.022092  normal  0.296556 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1590  ribosome biogenesis protein  38.54 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0045  Suppressor Mra1 family protein  37.44 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0747  ribosome biogenesis protein  38.79 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0675798  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1625  ribosome biogenesis protein  31.22 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0625  ribosome biogenesis protein  33.93 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02759  RNA processing protein Emg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06010)  30.77 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.458215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55133  predicted protein  28.57 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0189665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01990  nucleolar essential protein 1, putative  32.34 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39810  predicted protein  35.64 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.368845  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11653  predicted protein  45 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>