6 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0025 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 100 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>