41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6096 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  100 
 
 
358 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  82.77 
 
 
370 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  73.94 
 
 
356 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  68.47 
 
 
358 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  57.14 
 
 
359 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  56.86 
 
 
359 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  54.37 
 
 
381 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  49.58 
 
 
362 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  50.57 
 
 
364 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  51.56 
 
 
364 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  50 
 
 
364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  48.43 
 
 
362 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  48.58 
 
 
363 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  39.83 
 
 
364 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  39.5 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  39.36 
 
 
360 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  42.02 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  37.61 
 
 
360 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  42.46 
 
 
455 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  37.96 
 
 
358 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  35.98 
 
 
364 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  34.71 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  34.93 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  35.03 
 
 
362 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  34.44 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  30.79 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  30.51 
 
 
383 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  30.85 
 
 
384 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  27.93 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  30.81 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  30.25 
 
 
355 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  28.78 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  28.49 
 
 
379 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  27.71 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  29.58 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  26.16 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  26.67 
 
 
529 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  27.02 
 
 
529 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  25.96 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  25.96 
 
 
530 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  25.96 
 
 
530 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>