21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4172 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  74.03 
 
 
80 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  71.43 
 
 
80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  70.13 
 
 
80 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  58.44 
 
 
77 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  49.35 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  52.86 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  48.05 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  50.7 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.51473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  56.67 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  45.07 
 
 
288 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  45.83 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  44.74 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3615  hypothetical protein  50.77 
 
 
84 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3013  hypothetical protein  53.52 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2659  hypothetical protein  42.42 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125976  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  44 
 
 
561 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7281  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2631  hypothetical protein  32 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>