47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3637 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  72.48 
 
 
941 aa  1183    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  51.16 
 
 
940 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  45.26 
 
 
948 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  44.48 
 
 
937 aa  668    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  44.43 
 
 
957 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  47.59 
 
 
939 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  50.95 
 
 
943 aa  774    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  75.53 
 
 
945 aa  1283    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  100 
 
 
939 aa  1809    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  50.43 
 
 
937 aa  786    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  51.68 
 
 
939 aa  872    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  76.48 
 
 
943 aa  1292    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  51.61 
 
 
941 aa  812    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  44.57 
 
 
937 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  75.76 
 
 
945 aa  1309    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  73.45 
 
 
939 aa  1228    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  44.21 
 
 
942 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  44.22 
 
 
937 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  45.43 
 
 
949 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  50.65 
 
 
941 aa  775    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  51.17 
 
 
958 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  45.6 
 
 
942 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  50.92 
 
 
938 aa  801    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  50.42 
 
 
941 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  42.95 
 
 
921 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  40.17 
 
 
929 aa  539  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  43.34 
 
 
925 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  43.24 
 
 
925 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  41.4 
 
 
914 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  36.56 
 
 
932 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  40.31 
 
 
927 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  38.96 
 
 
940 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  34.79 
 
 
892 aa  327  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  40.88 
 
 
919 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  39.35 
 
 
639 aa  283  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  37.67 
 
 
924 aa  272  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  52.19 
 
 
279 aa  237  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  34.25 
 
 
255 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  33.93 
 
 
259 aa  97.8  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  33.93 
 
 
256 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  32.88 
 
 
256 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  32.02 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  28.04 
 
 
677 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  31.58 
 
 
720 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  32.93 
 
 
710 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  25.22 
 
 
316 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  31.73 
 
 
717 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>