34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1592 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1592  putative ferredoxin-NAD reductase component  100 
 
 
315 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1991  putative ferredoxin-NAD reductase component  54.97 
 
 
313 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2030  putative ferredoxin-NAD reductase component  56.11 
 
 
313 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2305  putative ferredoxin-NAD reductase component  55.17 
 
 
313 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0479254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0136  ferredoxin  42.06 
 
 
347 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0780915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0274  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.18 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2336  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.33 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126537  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  41.43 
 
 
352 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0219  ferredoxin  38.22 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  29.81 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  26.9 
 
 
344 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.82 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  25.69 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.17 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  25.94 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  31.07 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.44 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.52 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.19 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.18 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.49 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.21 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  32.65 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.56 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.5 
 
 
349 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  25.09 
 
 
343 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>