16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4990 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  348  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4940  hypothetical protein  87.71 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.260804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4476  hypothetical protein  87.57 
 
 		 179 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1416  hypothetical protein  72.04 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000277673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5029  hypothetical protein  59.7 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366968  normal  0.0139556 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11157  conserved hypothetical protein  47.1 
 
 		 250 aa  97.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2889  hypothetical protein  46.55 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216449  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2685  hypothetical protein  41.35 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.214698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2306  hypothetical protein  43.28 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1762  hypothetical protein  42.99 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2246  Ku protein  36.71 
 
 		 340 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  37.97 
 
 		 111 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  41.77 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  42.42 
 
 		 135 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  41.77 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>