22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1690 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  94.19 
 
 		 159 aa  265  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  94.19 
 
 		 159 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  58.46 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  48.48 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6821  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  48 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0739  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  31.67 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  31.08 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  30.71 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  31.45 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0536  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  25.9 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0522  hypothetical protein  31.01 
 
 		 196 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  26.43 
 
 		 196 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  27.86 
 
 		 182 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  23.08 
 
 		 173 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>