28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0275 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  86.47 
 
 		 584 aa  998    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1154    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  86.99 
 
 		 584 aa  1006    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  47.03 
 
 		 489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  47.61 
 
 		 424 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  27.3 
 
 		 443 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  26 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  28.78 
 
 		 516 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  29 
 
 		 521 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  28.88 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  28.78 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  28.78 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  28.75 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  29.32 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  24.93 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  26.62 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  26.89 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  27.7 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  24.16 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  25.97 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  26.44 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  25.85 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  23.49 
 
 		 380 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  23.03 
 
 		 393 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  31.78 
 
 		 297 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 		 316 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>