26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3307 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  100 
 
 
96 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  68.82 
 
 
105 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  70.59 
 
 
90 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  69.32 
 
 
89 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1701  monooxygenase component MmoB/DmpM  65.17 
 
 
90 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  65.52 
 
 
89 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  61.8 
 
 
89 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1329  monooxygenase component MmoB/DmpM  59.09 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  61.18 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  58.82 
 
 
89 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.65 
 
 
89 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  57.65 
 
 
89 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.12 
 
 
89 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.12 
 
 
89 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  52.94 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  46.43 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  43.75 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08840  phenol hydroxylase, monooxygenase component P2  42.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  44.74 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  44.74 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  39.76 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  37.84 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.58 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  33.78 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  38.1 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  30 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>