27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2542 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2542  toluene monooxygenase activator  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0817  toluene monooxygenase activator  69.89 
 
 
102 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1313  monooxygenase component MmoB/DmpM  56.31 
 
 
104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3817  monooxygenase component MmoB/DmpM  60.22 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0643335  normal  0.059628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5676  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.81 
 
 
105 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3559  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.46 
 
 
104 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4635  monooxygenase component MmoB/DmpM  54.46 
 
 
104 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4860  monooxygenase component MmoB/DmpM  42.05 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111656  normal  0.0554235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2199  monooxygenase component MmoB/DmpM  37.08 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.031469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0543  monooxygenase component MmoB/DmpM  39.33 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13468  normal  0.713388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1595  toluene-4-monooxygenase system protein D  38.46 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3114  monooxygenase component MmoB/DmpM  29.55 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0525  monooxygenase component MmoB/DmpM  35.9 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5682  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.33 
 
 
89 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4629  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.12 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0214  monooxygenase component MmoB/DmpM  32.97 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3553  monooxygenase component MmoB/DmpM  30.12 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2794  monooxygenase component MmoB/DmpM  31.71 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3795  monooxygenase component MmoB/DmpM  27.27 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0289368  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2283  phenol hydrolase activator  29.27 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0208  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.05 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3307  phenol hydrolase activator  38.1 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.560355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3309  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.57 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2969  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.92 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257392  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3361  monooxygenase component MmoB/DmpM  28.57 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1785  monooxygenase component MmoB/DmpM  29.27 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30740  Multi-component phenol hydoxylase, activator subunit; LapM  25.84 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>