14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0298 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0298  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  698    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784085  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0368  hypothetical protein  31.27 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000377368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 
630 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  23.46 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.15 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.39 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  26.65 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  27.27 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  24.65 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  24.65 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  27.61 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  23.08 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  31.87 
 
 
647 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  28.01 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>