14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0064 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0064  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.468559  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0045  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.112138  normal  0.31939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0048  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0005  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0062  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0042  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0005  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.150884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0007  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0934389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0043  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.362716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0067  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>