15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2622 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2622  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
110 aa  218  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.019184 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1044  cobalt transport protein CbiN  82.73 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1479  cobalt transport protein CbiN  50.98 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  39.25 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1403  cobalt transport protein CbiN  37.7 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0089  cobalt transport protein CbiN  40 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  35.92 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0696  cobalt transport protein CbiN  34.62 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0136  cobalt transport protein CbiN  34.55 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0702308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1767  cobalt transport protein CbiN  33.03 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  28.85 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0032  cobalt transport protein CbiN  34.38 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  33.91 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  27.88 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>