19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1044 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1044  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
110 aa  216  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2622  cobalt transport protein CbiN  82.73 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.019184 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1479  cobalt transport protein CbiN  52.94 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  38.89 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1403  cobalt transport protein CbiN  41.88 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0089  cobalt transport protein CbiN  41.11 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0696  cobalt transport protein CbiN  34.91 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0136  cobalt transport protein CbiN  35.45 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0702308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  35.92 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1767  cobalt transport protein CbiN  33.94 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0032  cobalt transport protein CbiN  32.61 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  28.57 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  27.62 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  37.8 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  30.38 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  30.38 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  30.38 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  27.62 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>