34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0414 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  48.57 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  52.94 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  50.71 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  45.8 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  56.43 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  42.62 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  46.77 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  40.87 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  37.9 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  41.32 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  33.11 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  45.16 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  38.21 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  40.46 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  41.35 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.51 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  40.98 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  40.48 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  32.77 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  34.43 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.06 
 
 		 356 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  38.21 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 		 356 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.67 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  32.5 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  43.16 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  36.94 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  29.27 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  35.14 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  34.43 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  40.82 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  31.48 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  26.09 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>