22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8120 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  97.37 
 
 		 312 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  47.65 
 
 		 450 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  55.36 
 
 		 452 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  55.36 
 
 		 452 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  55.36 
 
 		 452 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  55.36 
 
 		 452 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  55.36 
 
 		 452 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  54.46 
 
 		 452 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  55.22 
 
 		 433 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  62.67 
 
 		 385 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  27.49 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  27.49 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  27.49 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  27.49 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  27.49 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  27.49 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  36.7 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  32.26 
 
 		 458 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  32.26 
 
 		 458 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1877  hypothetical protein  41.43 
 
 		 80 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>