24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7603 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  843    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  76.44 
 
 
450 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  56.82 
 
 
452 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  56.82 
 
 
452 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  56.82 
 
 
452 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  56.82 
 
 
452 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  56.82 
 
 
452 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  56.58 
 
 
452 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  55.7 
 
 
385 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  58.26 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8496  hypothetical protein  87.78 
 
 
186 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  55.22 
 
 
205 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  30.46 
 
 
474 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  30.46 
 
 
474 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  30.46 
 
 
474 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  30.46 
 
 
474 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  30.46 
 
 
474 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  31.37 
 
 
428 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3752  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00106012  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3753  hypothetical protein  52.13 
 
 
105 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0113248  hitchhiker  0.00544666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  24.1 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  24.1 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3218  hypothetical protein  45.05 
 
 
172 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  27.71 
 
 
249 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>