19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7554 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  264  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  83.46 
 
 		 133 aa  225  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  61.79 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  59.35 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  59.35 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  36.96 
 
 		 455 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  35.44 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  32.89 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  38.54 
 
 		 457 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  32.71 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  32.95 
 
 		 369 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  32.94 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  35.9 
 
 		 332 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  31.88 
 
 		 359 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  30.61 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  32.88 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  31.15 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0973  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>