24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2977 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2977  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8120  hypothetical protein  97.37 
 
 
205 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1713  hypothetical protein  57.87 
 
 
452 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1677  hypothetical protein  57.87 
 
 
452 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0928  hypothetical protein  57.87 
 
 
452 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0364617  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0194  hypothetical protein  57.87 
 
 
452 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3465  hypothetical protein  57.87 
 
 
452 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.022849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0770  hypothetical protein  57.02 
 
 
452 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6371  hypothetical protein  53.52 
 
 
450 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7603  hypothetical protein  58.26 
 
 
433 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4710  hypothetical protein  58.46 
 
 
385 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4013  transposase, IS4  29.69 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2534  transposase, IS4  29.69 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1764  transposase, IS4  29.69 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0391  transposase, IS4  29.69 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0297  transposase, IS4  29.69 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0121  transposase, IS4  29.69 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0105  hypothetical protein  30.4 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3881  hypothetical protein  25.51 
 
 
458 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1179  hypothetical protein  25.51 
 
 
458 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3752  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00106012  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
880 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3420  hypothetical protein  32.65 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1877  hypothetical protein  38.57 
 
 
80 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>