25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2318 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2318  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0132  hypothetical protein  80.92 
 
 		 152 aa  249  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0119  hypothetical protein  78.95 
 
 		 152 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0765731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2917  hypothetical protein  58.91 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0325  hypothetical protein  44.29 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0589  hypothetical protein  46.46 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1785  hypothetical protein  56.3 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0590  hypothetical protein  46.03 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  53.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  34.78 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3957  hypothetical protein  32.76 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000108412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  35.38 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>