16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3263 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  48.51 
 
 
373 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  36.32 
 
 
429 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  37.07 
 
 
377 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  36.68 
 
 
424 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  39.79 
 
 
439 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  37.2 
 
 
557 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  37.43 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  37.3 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  33.51 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  36.97 
 
 
451 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  23.55 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  21.89 
 
 
444 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  27.03 
 
 
465 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  25.68 
 
 
465 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  21.8 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>